Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
A4D1N5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
A4D1N5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
A4D1N5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms