Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ICE1Q9Y2F5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms