Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX7Q9UNH6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms