Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms