Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms