Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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