Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USB1Q9BQ65 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USB1Q9BQ65 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms