Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPS6KC1Q96S38 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPS6KC1Q96S38 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms