Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms