Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HDAC11Q96DB2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms