Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPTSSAQ969W0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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