Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms