Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms