Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms