Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms