Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
USF2Q15853 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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