Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALX1Q15699 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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