Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SS18Q15532 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SS18Q15532 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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SS18Q15532 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SS18Q15532 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SS18Q15532 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SS18Q15532 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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