Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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