Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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ITGA9Q13797 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGA9Q13797 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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