Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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