Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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