Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EMX1Q04741 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms