Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK3Q00526 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK3Q00526 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms