Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD3P84022 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms