Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBP5P82980 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBP5P82980 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBP5P82980 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms