Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD40LGP29965 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD40LGP29965 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD40LGP29965 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD40LGP29965 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms