Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF4P18085 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF4P18085 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF4P18085 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF4P18085 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms