Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB3O43889 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms