Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNAP23O00161 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms