Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms