Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMED7Q9Y3B3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms