Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM35Q9UPQ4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM35Q9UPQ4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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