Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms