Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms