Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRBP1Q9P2E9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRBP1Q9P2E9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms