Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALCOCO1Q9P1Z2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms