Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms