Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms