Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF17Q9BXT8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms