Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT140Q96RY7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms