Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP2A3Q93084 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms