Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MYRIPQ8NFW9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms