Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms