Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLF2Q8IX21 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms