Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BROXQ5VW32 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms