Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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