Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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