Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNW1Q13573 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms