Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2Q13563 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2Q13563 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms